期刊简介
《国际检验医学杂志》创刊于1980年，原名《国外医学临床生物化学与检验学分册》，（ISSN 1673-4130 CN 50-1176/R），现由重庆市卫生局主管，重庆市卫生信息中心主办。2011年4月起改为半月刊，邮发代号国内78－26、国外M 6575。本刊辟有专家述评、专题、论著、临床检验研究、基础实验研究、硕博论坛、综述、调查报告、检验技术与方法、经验交流、质控与标规、仪器使用与排障、检验试剂评价、医学检验教育、检验科与实验室管理、个案与短篇等栏目。专题的稿件主要为约稿。
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首页>国际检验医学杂志
- 杂志名称：国际检验医学杂志
- 主管单位：重庆市卫生局
- 主办单位：重庆市卫生信息中心
- 国际刊号：1673-4130
- 国内刊号：50-1176/R
- 出版周期：半月刊
期刊荣誉：2005年荣获卫生部首届卫生医药优秀期刊三等奖期刊收录：上海图书馆馆藏, 剑桥科学文摘, 哥白尼索引(波兰), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 维普收录(中)
长链非编码RNA TUG1在肝细胞癌中的生物信息学分析
朱玉翠；张晓彤；周亚男；胡成进；曹源
关键词：肝细胞癌, 牛磺酸上调基因1, 靶基因, 生物信息学
摘要：目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)在肝细胞癌(HCC)中的意义,并对TUG1进行靶基因预测,为TUG1在HCC中的进一步研究提供借鉴.方法 利用UALCAN数据库分析TUG1在HCC中的差异表达,并对 TUG1进行生存分析.利用 RegRNA 2.0生物学软件、HMDD、tar-getscan、microT-CDS进行TUG1的靶基因预测,构建lncRNA TUG1-microRNAs-mRNAs调控网络.并运用FunRich平台对预测的靶基因进行Gene Ontology(GO)分析和KEGG信号转导通路富集分析.结果 TUG1在HCC中表达明显增高,随着肿瘤分级增高TUG1的表达呈上升趋势.lncRNA TUG1低表达患者的总生存期较高表达患者明显延长.TUG1上存在has-mir-122-5p、has-mir-200a-3p、has-mir-34c-3p、has-mir-629-3p这4个与 HCC相关microRNAs的可能结合位点,从而调节下游245个靶基因,形成了lncRNA TUG1-microR-Nas-mRNAs调控网络.在生物学过程中,microRNAs靶基因高度富集到碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢调节等过程.KEGG pathway分析中,microRNAs靶基因高度富集到Syndecan、TRAIL等介导的信号通路.结论 TUG1在HCC中表达水平增高,并与不良预后有关.利用生物信息学方法,可以从分子水平探究肿瘤发生机制,可为后续实验及临床诊疗提供有价值的信息.
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