期刊简介

               《国际检验医学杂志》创刊于1980年,原名《国外医学临床生物化学与检验学分册》,(ISSN 1673-4130  CN 50-1176/R),现由重庆市卫生局主管,重庆市卫生信息中心主办。2011年4月起改为半月刊,邮发代号国内78-26、国外M 6575。本刊辟有专家述评、专题、论著、临床检验研究、基础实验研究、硕博论坛、综述、调查报告、检验技术与方法、经验交流、质控与标规、仪器使用与排障、检验试剂评价、医学检验教育、检验科与实验室管理、个案与短篇等栏目。专题的稿件主要为约稿。                

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  • 杂志名称:国际检验医学杂志
  • 主管单位:重庆市卫生局
  • 主办单位:重庆市卫生信息中心
  • 国际刊号:1673-4130
  • 国内刊号:50-1176/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:2005年荣获卫生部首届卫生医药优秀期刊三等奖期刊收录:上海图书馆馆藏, 剑桥科学文摘, 哥白尼索引(波兰), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 维普收录(中)
国际检验医学杂志2017年第02期

PD-1与其他蛋白质的互作网络分析及验证

姜茹;姜杰;谭宏伟;修燕;王国艳

关键词:文献挖掘, 生物信息学, PD-1, PD-L1, PD-L2
摘要:目的:构建程序性死亡-1(PD-1)及其配体与其他蛋白质的相互作用网络,加深对 PD-1信号通路研究的认识,为 PD-1及其相关配体的基础及临床应用研究提供理论资料。方法通过 PubMed 检索 PD-1及其配体的研究文献,基于文献挖掘对已报道的与 PD-1及其配体存在相互作用的蛋白质进行统计,并以这部分蛋白质进行二次检索及文献挖掘统计,后用软件 Cyto-scape 构建相互作用网络并进行分析;寻找网络中与细胞迁移有关的分子及其与 PD-L1之间的关系,并利用荧光定量 PCR 及迁移试验进行验证。结果在构建出的 PD-1/PD-L1及 PD-1/PD-L2分子互作网络中分别共计122个、126个分子,这些分子在 T 细胞受体信号通路、细胞黏附、JAK-STAT 信号通路及细胞因子间相互作用等众多生物过程中起到重要作用;基于互作网络显示, PD-L1会间接影响到 CXCR4的表达,这一推测被荧光定量 PCR 及迁移试验结果所支持。结论通过生物信息学手段对互作网络蕴含的信息进行挖掘发现,PD-1/PD-L1通路与 PD-1/PD-L2通路的作用机制存在差异。同时,利用基于文献挖掘及生物信息学的方法研究 PD-1信号通路是1种可以合理利用生物文献数据,为实际试验提供指导的好方法。